مسجد مقدس جمکران در سال ۲۹۳ هجری قمری به دستور امام زمان (عج) ساخته شد.
در ۱۷ رمضان سال ۳۹۳ هجری قمری به دستور حضرت صاحب الامر (عج) مسجد مقدس جمکران به دست شیخ حسن مثله جمکرانی بنا شد.
مرحوم میرزا حسین نورى در کتاب نجم الثاقب درباره تاریخچه تأسیس مسجد
جمکران چنین مى‌نویسد: شیخ فاضل حسن بن حسن قمى، معاصر شیخ صدوق، در کتاب
تاریخ قم از کتاب مونس الحزین فى معرفة الحق و الیقین (از تألیفات شیخ
صدوق) بناى مسجد جمکران را به این عبارت نقل کرده است: شیخ عفیف صالح حسن
بن مثله جمکرانى مى‌گوید: من شب سه شنبه ۱۷ ماه مبارک سال ۳۹۳ هجری قمری در
خانه خود خوابیده بودم که ناگاه جماعتى از مردم به در خانه من آمدند و مرا
از خواب بیدار کردند و گفتند برخیز و خواسته امام مهدى (عج) را اجابت کن
که تو را مى‌خواند. آن‌ها مرا به محلى که اکنون مسجد (جمکران) است آوردند.